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表观遗传关键修饰:组蛋白乙酰化

更新时间:2026-07-02      点击次数:17

表观遗传失调通常与人类疾病,特别是与癌症有关,而各种针对表观遗传调节剂的药物也在如火如荼的开发。组蛋白修饰包括乙酰化,甲基化,泛素化,磷酸化,磺酰化,核糖基化等,其中组蛋白乙酰化修饰始终占据着核心地位。组蛋白乙酰化存在三步调控体系:组蛋白乙酰转移酶(HATs)作为 “写入器",向组蛋白赖氨酸残基添加乙酰基团;组蛋白去乙酰化酶(HDACs)充当 “擦除器",去除乙酰修饰以逆转该过程;溴结构域(Bromodomains)等蛋白模块则作为 “读取器",特异性结合乙酰化位点,介导染色质状态与基因转录的下游调控。

1、组蛋白乙酰转移酶(HATs)

组蛋白乙酰转移酶(HATs)催化乙酰基转移 (写入) 到组蛋白尾巴上的目标赖氨酸 (Lys或K) 残基的基团上,可以中和赖氨酸的正电荷,使浓缩的染色质松弛,促进基因转录的激活,还为具有识别该组蛋白修饰的 "结合基序蛋白" (如读取蛋白 BRDs) 提供了结合位点。常用的HTAs抑制剂如下表所示:

货号CAS名称特点
abs8145891889279-16-6A-485p300/CBP 的强效选择性抑制剂,对 p300 和 CBP 组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 的 IC 50 值分别为 9.8 nM 和 2.6 nM
abs817539328968-36-1C646选择性,竞争性的 p300 抑制剂,Ki 值为 400 nM
abs814163321695-57-2L002有效的,可逆的,特异性的乙酰转移酶 p300 (KAT3B) 抑制剂,IC 50 为 1.98 μM

2、组蛋白去乙酰化酶(HDACs)

组蛋白去乙酰化酶(HDACs)从高乙酰化组蛋白中除去乙酰基并抑制基因转录。哺乳动物中的 HDACs 分为四类:Zn2+依赖性的 I (HDAC1/2/3/8),II (IIa: HDAC4/5/7/9; IIb: HDAC6/10) 和 IV 类 HDAC (HDAC11),以及机制比较独特的NAD +依赖性的 III 类 HDAC,也称为Sirtuins (SIRT1-SIRT7)。组蛋白修饰与非编码RNA相互作用在糖尿病心肌病中的动态过程如下图[1]所示。

TSA(曲古抑菌素 A)是羟肟酸类 Zn²⁺型 HDAC 抑制剂,仅抑制Class I、II、IV;对 Class III Sirtuin 无任何抑制活性。烟酰胺(NAM)是Sirtuins竞争性抑制剂,仅阻断Class III(全部 SIRT1–7)对 Zn²⁺依赖的 I/II/IV 类 HDAC 无抑制效果。二者联用可以同时阻断 Zn²⁺型全部 HDAC + NAD⁺依赖 Sirtuins,实现四类 HDAC 全覆盖,这是表观实验经典的 “全 HDAC 广谱抑制组合"。常用的HDAC 抑制剂如下表所示:

货号CAS名称特点
abs81787658880-19-6Trichostatin A (TSA)特异 HDAC class I/II 抑制剂,对 HDAC 的 IC 50 值为 1.8 nM; Phase 1
abs817901128517-07-7RomidepsinPan-HDAC 抑制剂,抑制 HDAC1, HDAC2, HDAC4 和 HDAC6,IC 50 值分别为 36 nM, 47 nM, 510 nM 和 1.4 μM
abs81195599-66-1Valproic AcidPan-HDAC 抑制剂,抑制 HDAC1 的活性,(IC 50 =400 μM),同时诱导 HDAC2 的降解
abs810443112522-64-2TacedinalinePan-HDAC 抑制剂,抑制重组 HDAC 1, 2 和 3 的 IC 50 值分别为 0.9, 0.9, 1.2 μM; Phase 3
abs812019209783-80-2Entinostat选择性,可口服的 HDAC class I 抑制剂,抑制 HDAC1, HDAC2 和 HDAC3 的 IC 50 分别为 243 nM, 453 nM 和 248 nM; Phase 3
abs81696998-92-0NicotinamideNicotinamide 可抑制 SIRT2 的活性,其 IC50 值为 2 μM。Nicotinamide 也抑制 SIRT1。Nicotinamide 增加细胞内 NAD+、ATP、ROS 水平

3、溴结构域 (Bromodomains, BRDs)

溴结构域 (Bromodomains, BRDs) 被认为是第一个组蛋白结合模块。这类蛋白能够特异性识别组蛋白尾巴上的乙酰化赖氨酸残基,还可以结合非组蛋白的乙酰化赖氨酸残基。常用的BRD (BET) 抑制剂如下表所示:

货号CAS名称特点
abs810753202590-98-5Birabresib有效的 BRD2/3/4 抑制剂,IC50 值为 92-112 nM; Phase 2
abs8106281300031-49-5I-BET151BET溴结构域 (BET bromodomain) 抑制剂,抑制 BRD4, BRD2 和 BRD3 的 pIC50 分别为 6.1,6.3 和 6.6

4、客户验证案例举例

转染后12小时,细胞分别接受DMSO或TSA(abs817876,Absin,上海,中国)处理,浓度为1 µM,处理时间为24小时。

T细胞激活导致组蛋白乙酰化水平升高(abs817539,Absin,上海,中国) ,处理浓度为 5 µM。


参考文献

[1] DOI: 10.1002/cac2.12374

产品引用文献

[1] International journal of molecular sciences. DOI: 10.3390/ijms25063427 IF 5.7

[2] Clin Epigenetics. DOI: 10.1186/s13148-024-01634-w. IF 4.4

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